Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rin3P59729 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms