Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhbdl3P58873 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms