Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Paxbp1P58501 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms