Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpdl3bP58242 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms