Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp5P56399 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms