Protein–RNA interactions for Protein: P55849

Dsc1, Desmocollin-1, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc1P55849 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsc1P55849 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms