Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NcanP55066 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NcanP55066 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NcanP55066 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NcanP55066 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NcanP55066 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NcanP55066 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NcanP55066 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NcanP55066 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NcanP55066 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NcanP55066 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NcanP55066 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcanP55066 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcanP55066 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NcanP55066 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcanP55066 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NcanP55066 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcanP55066 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcanP55066 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcanP55066 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcanP55066 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcanP55066 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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NcanP55066 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NcanP55066 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NcanP55066 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NcanP55066 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NcanP55066 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms