Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NrlP54846 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NrlP54846 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NrlP54846 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NrlP54846 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NrlP54846 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NrlP54846 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NrlP54846 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NrlP54846 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NrlP54846 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NrlP54846 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NrlP54846 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NrlP54846 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NrlP54846 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NrlP54846 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NrlP54846 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NrlP54846 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NrlP54846 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NrlP54846 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NrlP54846 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NrlP54846 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NrlP54846 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NrlP54846 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms