Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad23aP54726 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms