Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fdft1P53798 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms