Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RabggtbP53612 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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