Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox5P52651 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms