Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Upp1P52624 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp1P52624 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms