Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc1a1P51906 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms