Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhx3P50481 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms