Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SftpdP50404 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms