Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxc13P50207 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms