Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Abcd1P48410 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms