Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx2P48379 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms