Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VdrP48281 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VdrP48281 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VdrP48281 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VdrP48281 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VdrP48281 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VdrP48281 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VdrP48281 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VdrP48281 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VdrP48281 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VdrP48281 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VdrP48281 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VdrP48281 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VdrP48281 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VdrP48281 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VdrP48281 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VdrP48281 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VdrP48281 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VdrP48281 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VdrP48281 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VdrP48281 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
VdrP48281 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VdrP48281 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms