Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccr7P47774 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccr7P47774 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms