Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NodalP43021 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NodalP43021 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NodalP43021 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NodalP43021 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NodalP43021 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NodalP43021 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NodalP43021 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NodalP43021 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NodalP43021 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NodalP43021 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NodalP43021 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NodalP43021 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NodalP43021 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NodalP43021 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NodalP43021 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NodalP43021 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NodalP43021 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NodalP43021 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NodalP43021 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NodalP43021 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NodalP43021 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NodalP43021 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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NodalP43021 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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NodalP43021 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NodalP43021 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NodalP43021 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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NodalP43021 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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NodalP43021 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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NodalP43021 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NodalP43021 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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