Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx1-2P42580 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms