Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tac1P41539 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tac1P41539 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tac1P41539 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms