Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl28P41105 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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