Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fen1P39749 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fen1P39749 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms