Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apoc1P34928 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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