Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim2P33610 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prim2P33610 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms