Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Saa4P31532 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms