Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc11P31313 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms