Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa2P31245 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa2P31245 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms