Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cd28P31041 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cd28P31041 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd28P31041 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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