Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnnd1P30999 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms