Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kif5cP28738 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms