Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrbP28704 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrbP28704 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrbP28704 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms