Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atxn10P28658 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atxn10P28658 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms