Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa2P28309 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms