Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb3P28231 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb3P28231 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms