Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjc1P28229 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms