Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vav1P27870 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms