Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfraP26618 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms