Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
U2af2P26369 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms