Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CftrP26361 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CftrP26361 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CftrP26361 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CftrP26361 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CftrP26361 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CftrP26361 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CftrP26361 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CftrP26361 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CftrP26361 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CftrP26361 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CftrP26361 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CftrP26361 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CftrP26361 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CftrP26361 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CftrP26361 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CftrP26361 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CftrP26361 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CftrP26361 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CftrP26361 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CftrP26361 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CftrP26361 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CftrP26361 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CftrP26361 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CftrP26361 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CftrP26361 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CftrP26361 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CftrP26361 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CftrP26361 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CftrP26361 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CftrP26361 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CftrP26361 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CftrP26361 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CftrP26361 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CftrP26361 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CftrP26361 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CftrP26361 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CftrP26361 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CftrP26361 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CftrP26361 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CftrP26361 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CftrP26361 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CftrP26361 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CftrP26361 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CftrP26361 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CftrP26361 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CftrP26361 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CftrP26361 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CftrP26361 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CftrP26361 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CftrP26361 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CftrP26361 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CftrP26361 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms