Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Coa4-202ENSMUST00000120454 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Hoxd11P23813 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Hoxd11P23813 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Hoxd11P23813 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Hoxd11P23813 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Hoxd11P23813 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Hoxd11P23813 Mterf4-201ENSMUST00000027492 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Hoxd11P23813 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd11P23813 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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