Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd12P23812 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms