Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tsta3P23591 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsta3P23591 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms