Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PparaP23204 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PparaP23204 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PparaP23204 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PparaP23204 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PparaP23204 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PparaP23204 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms