Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmnb2P21619 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms