Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P20040 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P20040 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
P20040 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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