Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P18525 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P18525 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P18525 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
P18525 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18525 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms